More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3006 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  92.55 
 
 
255 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  92.16 
 
 
255 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  79.3 
 
 
259 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  69.65 
 
 
255 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  69.65 
 
 
255 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  65.56 
 
 
264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  60.94 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  63.9 
 
 
264 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  58.98 
 
 
267 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  58.66 
 
 
258 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  61.42 
 
 
255 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  57.09 
 
 
255 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  60.17 
 
 
276 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  60.58 
 
 
242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  59.34 
 
 
256 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  56.3 
 
 
256 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  57.26 
 
 
264 aa  278  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.55 
 
 
255 aa  272  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  58.33 
 
 
250 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  54.33 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  54.94 
 
 
265 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  54.15 
 
 
283 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  54.15 
 
 
265 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  55.19 
 
 
264 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  57.08 
 
 
248 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  49.17 
 
 
263 aa  255  4e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  59.17 
 
 
250 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  51.76 
 
 
255 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.75 
 
 
252 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  58.75 
 
 
250 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  54.32 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  54.36 
 
 
261 aa  242  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.8 
 
 
255 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  57.32 
 
 
257 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  55.56 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  53.14 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  53.33 
 
 
273 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  41.57 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  52.38 
 
 
261 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  51.68 
 
 
247 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.68 
 
 
232 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  44.34 
 
 
212 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  37.82 
 
 
255 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.24 
 
 
238 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  41.04 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  40.87 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.24 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.64 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.34 
 
 
240 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.44 
 
 
246 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40 
 
 
260 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.73 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.11 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  43.61 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.55 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.58 
 
 
259 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.76 
 
 
263 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  35.59 
 
 
279 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.44 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  38.31 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  37.82 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  38.03 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.83 
 
 
242 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.57 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  33.88 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  33.84 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  35.83 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  34.55 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  38.74 
 
 
278 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  38.74 
 
 
266 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  39.41 
 
 
255 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  35.54 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.8 
 
 
242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  32.17 
 
 
266 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.98 
 
 
243 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.09 
 
 
255 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  38.49 
 
 
271 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  40.5 
 
 
259 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.93 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.6 
 
 
242 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.56 
 
 
243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.56 
 
 
243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  37.7 
 
 
253 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.56 
 
 
243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.56 
 
 
243 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  33.76 
 
 
249 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.18 
 
 
254 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  37.55 
 
 
278 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  37.55 
 
 
278 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  37.55 
 
 
278 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.84 
 
 
241 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  37.55 
 
 
278 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  39.04 
 
 
243 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.64 
 
 
238 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  123  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  37.55 
 
 
275 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  36.25 
 
 
252 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>