More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2463 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  44.93 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  43.87 
 
 
255 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  41.98 
 
 
255 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  43.27 
 
 
264 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  42.58 
 
 
264 aa  158  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  41.83 
 
 
255 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.51 
 
 
255 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  42.51 
 
 
283 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  42.51 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  42.38 
 
 
242 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  42.23 
 
 
250 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  41.71 
 
 
264 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  44.55 
 
 
267 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  43.4 
 
 
255 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  41.67 
 
 
263 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  43.06 
 
 
276 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  40.58 
 
 
265 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  40.76 
 
 
264 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  44.34 
 
 
255 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  43.4 
 
 
255 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  42.72 
 
 
248 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  39.34 
 
 
278 aa  146  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  43.06 
 
 
255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  42.79 
 
 
252 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.67 
 
 
259 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  42.51 
 
 
252 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  40.58 
 
 
261 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  41.23 
 
 
257 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  40.1 
 
 
256 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  39.52 
 
 
256 aa  139  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  40.38 
 
 
256 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  42.33 
 
 
247 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  40.48 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  37.8 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  42.99 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  33.17 
 
 
214 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  43.4 
 
 
273 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  40.78 
 
 
250 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  37.8 
 
 
258 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  41.26 
 
 
250 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  42.79 
 
 
257 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  38.62 
 
 
244 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  40.89 
 
 
254 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.87 
 
 
243 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.87 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  37.62 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  38.95 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.87 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.87 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  38.95 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  38.42 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  38.42 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 
243 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  34.67 
 
 
241 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.67 
 
 
241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  36.36 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  36.18 
 
 
243 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  37.62 
 
 
236 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  36.15 
 
 
268 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  35.03 
 
 
240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  35.35 
 
 
243 aa  108  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34.85 
 
 
243 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  39 
 
 
245 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  40.21 
 
 
261 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  34.78 
 
 
262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  34.34 
 
 
243 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 
253 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  34.01 
 
 
244 aa  105  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  38.38 
 
 
242 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.75 
 
 
263 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  35.05 
 
 
294 aa  104  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  36.22 
 
 
242 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.86 
 
 
234 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3598  hypothetical protein  37.02 
 
 
281 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0957834  normal  0.104911 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  38.28 
 
 
247 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  34.35 
 
 
262 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  34.74 
 
 
269 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  35.2 
 
 
244 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.1 
 
 
262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.02 
 
 
248 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  37.02 
 
 
252 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  35.18 
 
 
235 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  38 
 
 
256 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  35.18 
 
 
235 aa  101  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36.18 
 
 
242 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.84 
 
 
241 aa  101  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  32.21 
 
 
279 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.89 
 
 
244 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  34.44 
 
 
239 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.06 
 
 
242 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.85 
 
 
232 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>