More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0423 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  58.16 
 
 
273 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  52.52 
 
 
255 aa  214  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  51.68 
 
 
255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  48.97 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  51.68 
 
 
255 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  48.21 
 
 
255 aa  204  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  50.42 
 
 
255 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  50.63 
 
 
259 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  45.64 
 
 
264 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  46.91 
 
 
276 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  48.32 
 
 
252 aa  185  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  45.64 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  43.98 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  44.81 
 
 
264 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  38.11 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  45.83 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  41.84 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  41.84 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  47.52 
 
 
267 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  43.51 
 
 
265 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  45.34 
 
 
248 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  45.95 
 
 
253 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  45.87 
 
 
257 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  46.06 
 
 
242 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  46.94 
 
 
255 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  43.95 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  46.34 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  37.76 
 
 
263 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  43.04 
 
 
254 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  48.95 
 
 
257 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  45.08 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  42.8 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  42.46 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  45.27 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  43.75 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  43.95 
 
 
250 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  42.74 
 
 
261 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  44.4 
 
 
250 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  40.42 
 
 
256 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.57 
 
 
232 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  42.56 
 
 
261 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  42.33 
 
 
212 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 
255 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  42.29 
 
 
241 aa  135  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  42.37 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.69 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  42.92 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  39.66 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.19 
 
 
244 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  39.08 
 
 
279 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  43.19 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  42.79 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  37.02 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  42.59 
 
 
240 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  42.11 
 
 
255 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  34.55 
 
 
263 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.92 
 
 
267 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  38.1 
 
 
272 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  37.74 
 
 
283 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.84 
 
 
267 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.92 
 
 
223 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.69 
 
 
266 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  39.17 
 
 
269 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  38.55 
 
 
271 aa  121  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  39.27 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  39.27 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  39.32 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  41.04 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  41.22 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  41.04 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  39.29 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  37.98 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  39.84 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.18 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  41.26 
 
 
242 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  36.78 
 
 
243 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  38.22 
 
 
256 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  38.99 
 
 
260 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.93 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.63 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  42.13 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.63 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.63 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  37.67 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.63 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  36.78 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  39.09 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.73 
 
 
242 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  34.6 
 
 
249 aa  118  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.7 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  37.25 
 
 
285 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>