More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0618 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  69.17 
 
 		 250 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  67.45 
 
 		 252 aa  341  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  62.75 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  67.59 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  67.59 
 
 		 250 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  61.81 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  53.52 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  55.14 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  54.32 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  53.91 
 
 		 264 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  54.26 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  51.76 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  50.59 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  49.8 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  49.81 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  50.97 
 
 		 255 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  51.17 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  51.45 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.39 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  50.41 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  50.82 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  50.41 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.09 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  52.55 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  50.62 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  51.02 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  48.83 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  52.48 
 
 		 242 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  49.41 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  51.17 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  51.18 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  46.88 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  48.24 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  48.64 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  40.73 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  43.95 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  47.18 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  45.1 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  43.87 
 
 		 212 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  40.4 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  38.78 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.49 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.5 
 
 		 241 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.85 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  38.14 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  40.25 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.74 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.24 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  38.8 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  39.41 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.35 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  39.83 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  38.58 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  38.08 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  35.1 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  37.66 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.24 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.16 
 
 		 240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  36.65 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  38.36 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.83 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.82 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.32 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.74 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  38.4 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.58 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  36.47 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  37.71 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.01 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  34.9 
 
 		 272 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  38.4 
 
 		 241 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.69 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  34.25 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  35.29 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  39.71 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  36.86 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.82 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  32.95 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.06 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  36.86 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  34.75 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  39.83 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>