More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3109 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  97.65 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  92.55 
 
 		 255 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  81.64 
 
 		 259 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  68.48 
 
 		 255 aa  342  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  67.32 
 
 		 255 aa  332  5e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  60.94 
 
 		 257 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  64.73 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  62.24 
 
 		 264 aa  298  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  58.2 
 
 		 267 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  61.83 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  57.87 
 
 		 258 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  57.09 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  61.41 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  60.63 
 
 		 255 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  58.09 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  60.58 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  56.69 
 
 		 256 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.94 
 
 		 255 aa  276  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  55.12 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  54.55 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  54.77 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  54.94 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  54.55 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.42 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  49.59 
 
 		 263 aa  256  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  56.85 
 
 		 261 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  55.83 
 
 		 248 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  53.33 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  57.5 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.8 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  53.5 
 
 		 254 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  54.39 
 
 		 252 aa  241  6e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  57.32 
 
 		 257 aa  241  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  57.08 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  53.97 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.17 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  52.52 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  40.78 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.4 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  43.12 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  41.22 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.24 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  41.43 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  43.18 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.24 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.04 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.24 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.97 
 
 		 255 aa  136  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.27 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.66 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.51 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.13 
 
 		 260 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  38.55 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.06 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  38.46 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.66 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.71 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  37.29 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  38.25 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.95 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.6 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  36.2 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  38.82 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  32.56 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.08 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  38.49 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  36 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.31 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  35.75 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  34.6 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  36.69 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  35.56 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.53 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  36.6 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  41.05 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.64 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  36.18 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.56 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  36.14 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.3 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  41.18 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0498  hypothetical protein  39.04 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  35.83 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  35.37 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  36.76 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.09 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  36.76 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  36.76 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  36.76 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  39.04 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  36.76 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  35.93 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.43 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>