More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  67.24 
 
 		 253 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  70.04 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  64.81 
 
 		 252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  61.04 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  60.53 
 
 		 229 aa  264  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  64.22 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  61.8 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  60.68 
 
 		 236 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  54.22 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  50.21 
 
 		 238 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  49.79 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  48.91 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  50.44 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  53.48 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  51.1 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  49.78 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  49.13 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.05 
 
 		 244 aa  175  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  43.72 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  46.85 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  50.43 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.05 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.92 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  48.7 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  45.02 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  41.1 
 
 		 240 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  38.3 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  44.64 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.55 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  39.39 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  42.55 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  36.79 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.43 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.57 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  38.93 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.25 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  38.93 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  38.53 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.49 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.05 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.89 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.66 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.71 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.71 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.34 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.74 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  45.66 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  39.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.25 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  39.22 
 
 		 243 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.39 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  34.2 
 
 		 239 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  39.22 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  40.17 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.24 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  39.22 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  36.76 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  45.64 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  38.93 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  39.51 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  44.75 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  38.33 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  41.1 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  37.98 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  43.58 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  37.98 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  37.77 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  37.98 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  35.27 
 
 		 261 aa  124  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  41.53 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  36.73 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  45.09 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.82 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.82 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  39.92 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  38.57 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  36 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  44.9 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>