More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3533 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  69.02 
 
 		 261 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  61.81 
 
 		 256 aa  307  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  60.63 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  60.24 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  62.66 
 
 		 242 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  59.61 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  295  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  57.48 
 
 		 258 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  57.87 
 
 		 267 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  57.54 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  58.89 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  61.41 
 
 		 255 aa  288  9e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  59.14 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  61.41 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  59.34 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  58.75 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  56.67 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  57.92 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  56.67 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  55.42 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  56.85 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  56.67 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  53.73 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  49.19 
 
 		 263 aa  259  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  54.94 
 
 		 276 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  54.17 
 
 		 250 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  53.82 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  50.59 
 
 		 252 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.62 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  51.02 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  54.58 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  54.17 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  51.45 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  49.79 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  49.4 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  49.6 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  47.93 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  36.68 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  40.42 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.55 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.1 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.19 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.19 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.29 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  38.2 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  38.49 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  38.1 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  36.49 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.21 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  36.49 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  36.21 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.95 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.11 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  37.7 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  38.86 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.24 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  40.93 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  37.99 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  35.62 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  32.68 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.49 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.23 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  35.94 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  38.24 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.55 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  36.33 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  37.84 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  36.4 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  32.93 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.88 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  32.66 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  38.03 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.15 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  32.79 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.04 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  36.7 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  34.84 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  36.7 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.15 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  35.02 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  36.7 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  32.79 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  35.8 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  35.8 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.49 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  35.8 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  33.47 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  34.08 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  35.19 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.76 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>