More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1133 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 261 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  69.02 
 
 		 256 aa  352  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  62.1 
 
 		 267 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  62.4 
 
 		 255 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  62.55 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  61.41 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  60.33 
 
 		 258 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  60.58 
 
 		 255 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  54.41 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  54.41 
 
 		 265 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  59.5 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  55.6 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  53.67 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  57.44 
 
 		 256 aa  271  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  54.37 
 
 		 276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  56.32 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  53.88 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  55.04 
 
 		 264 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  56.85 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  56.25 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  53.49 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  56.85 
 
 		 255 aa  254  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  56.02 
 
 		 255 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  50.95 
 
 		 255 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  54.36 
 
 		 255 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.75 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  52.72 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  52.28 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  50.62 
 
 		 255 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  48.35 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  55.27 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  54.85 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  49.59 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  47.24 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  50.83 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  51.02 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  47.76 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  47.66 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  48.02 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  35.32 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  42.74 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.58 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.2 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.94 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  37.82 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  38.77 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  35.46 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  35.46 
 
 		 264 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.81 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.89 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.44 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.8 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.74 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.95 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.43 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.1 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  39.24 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  35.25 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  36.32 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  38.43 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  36.48 
 
 		 240 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  39.73 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.34 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1679  protein of unknown function DUF152  34.47 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  35.11 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.41 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.19 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.25 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.27 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  33.95 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  33.95 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  35.02 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  33.95 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  34.41 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  34.85 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  34.44 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.44 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  36.57 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  37.55 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  34.39 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  32.34 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.73 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  36.73 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  32.66 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2076  hypothetical protein  33.71 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.106201  normal  0.943331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  37.33 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>