More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2211 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  64.31 
 
 		 250 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  61.81 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  64.17 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  63.78 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  63.92 
 
 		 250 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  63.53 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  55.47 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  54.07 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  54.32 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  54.32 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  53.5 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  51.15 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  53.06 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  52.44 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  50.82 
 
 		 265 aa  235  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  51.44 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  49.18 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  46.82 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  51.81 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  49.61 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  48.58 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  49.01 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  53.17 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  50.59 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  52.24 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  40.46 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  48 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  48.82 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  49.79 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  48.43 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  48.56 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  49.6 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  47.84 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  47.76 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  44.62 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  47.86 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  44.14 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  36.23 
 
 		 278 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  43.04 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  46.37 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  34.39 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  35.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  39.77 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  39.02 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  35.66 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  39.67 
 
 		 265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  40.16 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  37.8 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.57 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.57 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.89 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  38.72 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.59 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  37.21 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  35.55 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  34.11 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  39.06 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.25 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  38.67 
 
 		 252 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.76 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.18 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  36.03 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.84 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  37.8 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.48 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  33.89 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.4 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  38.33 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  35.27 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  38.53 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.33 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  39.83 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  39.22 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  38.26 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  35.74 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  33.05 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  40.09 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  34.84 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  36.93 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.22 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  37.97 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.92 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.29 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  35.97 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.43 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  34.56 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.61 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  39.3 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.3 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  36.14 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  37.2 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  32.24 
 
 		 273 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  34.55 
 
 		 311 aa  118  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  39.27 
 
 		 227 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.07 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  36.99 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.78 
 
 		 232 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>