More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5410 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  81.64 
 
 
255 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  81.64 
 
 
255 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  79.3 
 
 
255 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  71.09 
 
 
255 aa  347  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  69.92 
 
 
255 aa  340  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  61.33 
 
 
257 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  61.66 
 
 
264 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  60.47 
 
 
264 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  58.66 
 
 
255 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  63.07 
 
 
242 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  61.57 
 
 
276 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  58.2 
 
 
267 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  61.02 
 
 
255 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  58.09 
 
 
283 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  58.09 
 
 
265 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  59.14 
 
 
256 aa  287  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  57.09 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  56.76 
 
 
264 aa  280  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  54.94 
 
 
264 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  54.94 
 
 
265 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  56.69 
 
 
256 aa  277  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  56.69 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  53.75 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  56.35 
 
 
250 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  56.32 
 
 
261 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  47.72 
 
 
263 aa  257  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  56.07 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  56.85 
 
 
248 aa  250  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  55.47 
 
 
254 aa  249  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  59.18 
 
 
250 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  59.51 
 
 
250 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  50.2 
 
 
255 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  51.45 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  54.33 
 
 
257 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  54.15 
 
 
253 aa  228  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  51.97 
 
 
252 aa  228  9e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.81 
 
 
273 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.2 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  39.06 
 
 
278 aa  202  6e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  50.63 
 
 
247 aa  192  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  43.24 
 
 
232 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  40.42 
 
 
263 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.67 
 
 
212 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.69 
 
 
238 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  41.91 
 
 
252 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  40.61 
 
 
255 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.53 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  36.51 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  41.82 
 
 
228 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  38.33 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  38.83 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  41.08 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  41.06 
 
 
252 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  36.75 
 
 
270 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  39.06 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  35.87 
 
 
241 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.35 
 
 
240 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.08 
 
 
255 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.85 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  39.65 
 
 
238 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  35.43 
 
 
241 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.66 
 
 
259 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  37.55 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.25 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.17 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  38.33 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  37.38 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  37.15 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  36.89 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  37.15 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  37.15 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  37.15 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.34 
 
 
255 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  40.6 
 
 
223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.77 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  33.47 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.82 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  40.66 
 
 
241 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  37.82 
 
 
274 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.33 
 
 
234 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.76 
 
 
263 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.55 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  33.85 
 
 
253 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.72 
 
 
227 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.66 
 
 
240 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  42.37 
 
 
260 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 
249 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  39.66 
 
 
229 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  37.28 
 
 
272 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.97 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.1 
 
 
266 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  40.59 
 
 
250 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  36.8 
 
 
249 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  37.08 
 
 
276 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.71 
 
 
254 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  35.97 
 
 
243 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  37.82 
 
 
242 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.95 
 
 
241 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  39.92 
 
 
239 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>