More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2760 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
264 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  92.42 
 
 
264 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  70.72 
 
 
264 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  64.5 
 
 
276 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  61.07 
 
 
264 aa  324  9e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  63.9 
 
 
255 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  60.47 
 
 
259 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  62.24 
 
 
255 aa  298  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  61.89 
 
 
267 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  56.92 
 
 
265 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  61.41 
 
 
255 aa  295  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  63.07 
 
 
242 aa  294  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  55.17 
 
 
283 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  55.17 
 
 
265 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  60.63 
 
 
255 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  58.66 
 
 
258 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  60.24 
 
 
257 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  59.34 
 
 
255 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  58.26 
 
 
255 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  57.48 
 
 
256 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  59.75 
 
 
255 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  57.92 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  56.35 
 
 
256 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  47.45 
 
 
263 aa  268  5e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  58.09 
 
 
252 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  53.49 
 
 
261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  54.32 
 
 
255 aa  255  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  55.02 
 
 
250 aa  254  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  54.12 
 
 
248 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  55.82 
 
 
250 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  55.82 
 
 
250 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  49.79 
 
 
255 aa  234  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  51.44 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  53.53 
 
 
255 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  53.91 
 
 
257 aa  227  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  53.72 
 
 
253 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  53.53 
 
 
252 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  51.78 
 
 
261 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  40.5 
 
 
278 aa  192  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  49.37 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  45.64 
 
 
247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  45.62 
 
 
232 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.76 
 
 
212 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  36.02 
 
 
240 aa  143  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  41.3 
 
 
255 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  45.83 
 
 
223 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  40.61 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  41.44 
 
 
260 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  40.83 
 
 
242 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  41.35 
 
 
265 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  38.94 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  35.63 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.93 
 
 
240 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  38.84 
 
 
242 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  34.8 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  35.17 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  40.09 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.67 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.91 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.29 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  40.27 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.16 
 
 
246 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.3 
 
 
264 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  40.5 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  42.08 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.63 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.3 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  35.17 
 
 
241 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  40.51 
 
 
236 aa  129  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.82 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  32.9 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.28 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  34.82 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  38.56 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.17 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  42.34 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  41.39 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  39.41 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.66 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.48 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  38.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  39.35 
 
 
243 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  40.37 
 
 
254 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  34.32 
 
 
244 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  39.55 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  39.35 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  40.33 
 
 
252 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  39.61 
 
 
246 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  34.13 
 
 
272 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  33.89 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  38.65 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  33.9 
 
 
242 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  34.45 
 
 
260 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  38.43 
 
 
243 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>