More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2550 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  63.53 
 
 
257 aa  327  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  60.63 
 
 
258 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  61.81 
 
 
267 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  61.02 
 
 
255 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  63.07 
 
 
242 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  59.45 
 
 
256 aa  308  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  61.02 
 
 
259 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  61.42 
 
 
255 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  59.61 
 
 
255 aa  298  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  59.22 
 
 
255 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  57.87 
 
 
256 aa  298  6e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  60.63 
 
 
255 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  59.84 
 
 
255 aa  292  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  53.73 
 
 
256 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  51.98 
 
 
255 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  50.95 
 
 
261 aa  256  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  51.59 
 
 
255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  52.02 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  52.07 
 
 
276 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  53.53 
 
 
264 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  53.11 
 
 
264 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  49.38 
 
 
283 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  48.02 
 
 
265 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  48.41 
 
 
265 aa  235  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  49.59 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  52.76 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  45.68 
 
 
263 aa  230  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  49.61 
 
 
255 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  50.82 
 
 
248 aa  218  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  51.88 
 
 
273 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  49.6 
 
 
254 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  51.98 
 
 
250 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  47.06 
 
 
252 aa  208  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  52.36 
 
 
250 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  47.66 
 
 
252 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  39.13 
 
 
278 aa  202  6e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  50.79 
 
 
261 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  48.24 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  47.22 
 
 
253 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  45.08 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.48 
 
 
212 aa  141  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.46 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  38.98 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  35.06 
 
 
240 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  39.92 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  40.4 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.4 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.51 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.76 
 
 
244 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  34.75 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  41.18 
 
 
228 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.44 
 
 
255 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  40.36 
 
 
238 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.43 
 
 
255 aa  122  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 
272 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.99 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  35.71 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  40.35 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.74 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  36.51 
 
 
256 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.78 
 
 
232 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  40.68 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.63 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  35.5 
 
 
242 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  34.08 
 
 
214 aa  118  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  35.79 
 
 
285 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  34.2 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  42.95 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.8 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  37.17 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 
262 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  39.17 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  39.15 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.74 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  35.98 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.55 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  35.15 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  39.17 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  38.5 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  36.29 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  37.01 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.27 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.76 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  33.07 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  35.89 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  35.74 
 
 
264 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  35.74 
 
 
264 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.61 
 
 
279 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  34.09 
 
 
268 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  31.05 
 
 
293 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 
254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  35.56 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  34.52 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  33.76 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  34.92 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.27 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  38.31 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>