More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1114 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  60.34 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  55.93 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  56.09 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  54.22 
 
 		 234 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  56 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  54.59 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  54.39 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  55.8 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  55.8 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  55.8 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  51.72 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  51.54 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  56.89 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  52.25 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  49.33 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  51.32 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  54.22 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  52.91 
 
 		 236 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.35 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  54.02 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  47.21 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  48 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.34 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  52.38 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.15 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  43.53 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  50.82 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  43.57 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  46.44 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  43.04 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  39.27 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  42.31 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  42.74 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  42.74 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  40.59 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  41 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  42.31 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  40.59 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  39.76 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  40.59 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  40.59 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.75 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  40 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.98 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  40.61 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.22 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  43.61 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  42.29 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  39.39 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  43.61 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  35.83 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  34.58 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.39 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  40.57 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.51 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  38.17 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  40.26 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  36.63 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  39.83 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.57 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  41.63 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.63 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.04 
 
 		 260 aa  128  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  34.8 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  36.44 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.47 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  41.52 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  41.18 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  41.05 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  31.72 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  40.66 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  35.34 
 
 		 262 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  38.82 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  39.66 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3598  hypothetical protein  38.22 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0957834  normal  0.104911 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.44 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  40.95 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  37.45 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  34.53 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  42.24 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.37 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  38.4 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  37.34 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  35.34 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  35.34 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  40.81 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  43.72 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  33.48 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>