More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1083 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  662    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  60.58 
 
 
321 aa  368  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.67 
 
 
255 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  38.6 
 
 
238 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  33.82 
 
 
238 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  40.95 
 
 
228 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  38.57 
 
 
241 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.25 
 
 
234 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  31.65 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  41.41 
 
 
264 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  34.11 
 
 
239 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.7 
 
 
244 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  37.33 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  34.69 
 
 
251 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  36.57 
 
 
261 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  35.5 
 
 
249 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  37.96 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  42.47 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  38.4 
 
 
255 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  38.86 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  32.76 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  38.36 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  36.96 
 
 
255 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  37.39 
 
 
230 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  37.39 
 
 
230 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  37.5 
 
 
263 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  37.39 
 
 
230 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  37.57 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  37.86 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  38.74 
 
 
267 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  39.25 
 
 
264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  35.4 
 
 
257 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  33.55 
 
 
248 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  35.48 
 
 
252 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  36.12 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  29.86 
 
 
253 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  38.92 
 
 
265 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  31.36 
 
 
293 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  34.38 
 
 
254 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  35.04 
 
 
258 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  32.57 
 
 
252 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  36.46 
 
 
255 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  33.22 
 
 
255 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  37.09 
 
 
223 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  34.86 
 
 
253 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  33.67 
 
 
250 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  35.78 
 
 
246 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  33.76 
 
 
256 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  31.47 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  37.11 
 
 
242 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  39.33 
 
 
255 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  37.37 
 
 
253 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  38.71 
 
 
255 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  30.31 
 
 
229 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  35.32 
 
 
240 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  35.32 
 
 
246 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  37.56 
 
 
252 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  38.68 
 
 
241 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.62 
 
 
263 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  31.98 
 
 
241 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  38.07 
 
 
263 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  34.08 
 
 
259 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 
264 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 
264 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  31.98 
 
 
241 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  38.25 
 
 
261 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  32.91 
 
 
227 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  34.18 
 
 
275 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  35 
 
 
242 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  36.79 
 
 
255 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  30.49 
 
 
240 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.88 
 
 
244 aa  99.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.07 
 
 
244 aa  99  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.57 
 
 
243 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.43 
 
 
259 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  31.79 
 
 
243 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  32.58 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  35.94 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  35.2 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  37.08 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  34.88 
 
 
255 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  32.11 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  32.54 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  35.96 
 
 
246 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.25 
 
 
266 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  32.18 
 
 
260 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  33.94 
 
 
246 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  32.24 
 
 
245 aa  96.3  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  32.62 
 
 
248 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  39.89 
 
 
255 aa  96.3  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  33.63 
 
 
241 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  37.66 
 
 
246 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  31.58 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.02 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  27.51 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  35.32 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>