More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2406 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
261 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  51.01 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  53.36 
 
 
274 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  48.71 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  45.92 
 
 
229 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  47.7 
 
 
241 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  46.45 
 
 
235 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  47.92 
 
 
249 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  48.12 
 
 
238 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  48.57 
 
 
238 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  51.85 
 
 
251 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.35 
 
 
234 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  45.65 
 
 
229 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  49.38 
 
 
241 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  43.61 
 
 
224 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  43.17 
 
 
227 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  45.69 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  50.21 
 
 
243 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  46.72 
 
 
228 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  44.87 
 
 
252 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  44.77 
 
 
239 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  51.04 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  44.44 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  43.35 
 
 
230 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  43.35 
 
 
230 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  43.35 
 
 
230 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.98 
 
 
228 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  44.44 
 
 
250 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  41.51 
 
 
283 aa  132  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  44.87 
 
 
240 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  46.03 
 
 
236 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  32.86 
 
 
321 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  40.6 
 
 
246 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  39.6 
 
 
264 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  39.6 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  36.36 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  45.09 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  37.45 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  40.23 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  40.71 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  33.19 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.89 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  33.05 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  31.8 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.76 
 
 
241 aa  113  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  37.2 
 
 
255 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  36.51 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  40.43 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  37.87 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  37.87 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  38.36 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  36.55 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.53 
 
 
239 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  41.99 
 
 
255 aa  109  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  37.87 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  38.02 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.56 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  37.3 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  37.04 
 
 
265 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  38.36 
 
 
244 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  36.02 
 
 
240 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  38.71 
 
 
255 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  37.96 
 
 
259 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  40.74 
 
 
255 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  38.53 
 
 
256 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.34 
 
 
264 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  36.67 
 
 
248 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  37.34 
 
 
264 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  35.15 
 
 
248 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  37.99 
 
 
247 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  38.24 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  35.55 
 
 
255 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  43.9 
 
 
260 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  39.75 
 
 
255 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  38.84 
 
 
250 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  37.44 
 
 
276 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  38.86 
 
 
257 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  38.33 
 
 
264 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  37.4 
 
 
257 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  33.6 
 
 
267 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  40.71 
 
 
273 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  31.73 
 
 
279 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  37.96 
 
 
272 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.05 
 
 
254 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  38.53 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  36.44 
 
 
244 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  35.5 
 
 
242 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  34.38 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  40 
 
 
252 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  35.92 
 
 
261 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.95 
 
 
242 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  36.24 
 
 
233 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  37.82 
 
 
242 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  32.26 
 
 
249 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  29.55 
 
 
270 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  36.89 
 
 
256 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  34.38 
 
 
255 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.52 
 
 
246 aa  100  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>