More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3797 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
255 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  60.44 
 
 
230 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  60.44 
 
 
230 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  60.44 
 
 
230 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  54.69 
 
 
252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  55.95 
 
 
253 aa  236  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  57.71 
 
 
229 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  53.48 
 
 
234 aa  229  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  53.95 
 
 
238 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  52.65 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  56.96 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  54.22 
 
 
241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  53.98 
 
 
228 aa  215  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  54.87 
 
 
228 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  57.71 
 
 
243 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  51.98 
 
 
238 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  56.89 
 
 
236 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  50.66 
 
 
224 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  48 
 
 
246 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  48.95 
 
 
274 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  46.09 
 
 
227 aa  175  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.91 
 
 
244 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  44.98 
 
 
249 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.49 
 
 
255 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  48.05 
 
 
251 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  47.14 
 
 
241 aa  155  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  43.78 
 
 
229 aa  152  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  46.55 
 
 
261 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  44.69 
 
 
264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.4 
 
 
326 aa  142  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  37.71 
 
 
246 aa  141  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  42.92 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  34.03 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  37.99 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.47 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.24 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  39.73 
 
 
283 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  42.17 
 
 
240 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  34.02 
 
 
239 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  38.56 
 
 
248 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  33.91 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  41.1 
 
 
244 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  39.58 
 
 
264 aa  135  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  39.58 
 
 
264 aa  135  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  40.89 
 
 
255 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  38.62 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  43.97 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  37.02 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  36.96 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  38.28 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  35.65 
 
 
242 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.63 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  40.43 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  38.77 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  39.08 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  42.99 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  41.3 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  35.42 
 
 
249 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  40.83 
 
 
252 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  36.47 
 
 
262 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  39.26 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  41.81 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  38.86 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  39.75 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  38.86 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  38.86 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  38.86 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.7 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  38.43 
 
 
243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  39.45 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  39.22 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  39.22 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.43 
 
 
246 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  38.43 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  38.43 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  40.35 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  42.45 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  37.07 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  38.08 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  35.65 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  37.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  38.43 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  38.79 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  37.66 
 
 
283 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  37.66 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.99 
 
 
254 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  41.2 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  41.84 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  38.89 
 
 
264 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  41.1 
 
 
271 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.54 
 
 
250 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  41.56 
 
 
231 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  37.25 
 
 
254 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  39 
 
 
256 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  39.08 
 
 
229 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.91 
 
 
244 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>