More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.85 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  43.53 
 
 		 241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  51.42 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  45.61 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  42.49 
 
 		 229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  41.15 
 
 		 235 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.02 
 
 		 244 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  42.41 
 
 		 224 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.36 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  39.46 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  41.78 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.35 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  41.07 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  40.17 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  40.79 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  41.59 
 
 		 228 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  40.62 
 
 		 227 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  41.78 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  41.78 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  41.78 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  40.75 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  42.29 
 
 		 236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  43.75 
 
 		 243 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  39.42 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  39.73 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  40.77 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  36.21 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  39.18 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  43.52 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  35.75 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.1 
 
 		 273 aa  112  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  41.45 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  31.3 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  25.22 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  35.47 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  34.65 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  32.05 
 
 		 262 aa  99  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  33.04 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.78 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  34.62 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  27.35 
 
 		 229 aa  95.1  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  34.18 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  32.2 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  35.34 
 
 		 246 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  34.76 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  30.83 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  37.77 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  31.25 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  30.6 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  33.2 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  35.62 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.93 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  32.31 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  28.76 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  32.9 
 
 		 241 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  31.85 
 
 		 279 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  34.15 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  30.47 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  34.89 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  31.44 
 
 		 244 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  32.2 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  31.56 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  29.26 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.2 
 
 		 246 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  30.04 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  31.15 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  26.81 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  34.02 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  30.09 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  32.02 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  32.6 
 
 		 265 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  35.65 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  35.78 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  34.44 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  26.38 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  31.2 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  32.76 
 
 		 241 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  25.43 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  34.3 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  35.83 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  34.66 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  30.12 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  32.65 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  34.44 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  35.83 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  31.64 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  29.52 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  35.83 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  35.83 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  34.17 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  31.42 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  35.83 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>