More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3059 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  53.37 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  46.19 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  52.49 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  46.19 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  47.46 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  50.78 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  44.54 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  40.93 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  41.35 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  42.24 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  49.16 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  46.22 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  44.9 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  45.81 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  41.98 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  47.19 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  43.16 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  43.52 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  43.13 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  43.13 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  43.13 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.01 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  45.51 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  47.85 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  41.3 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  41.56 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  49.44 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  43.33 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  45.99 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  39.66 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  35.65 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  35.14 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  39.2 
 
 		 326 aa  85.5  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  42.08 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  37.5 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.22 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  28.44 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  28.51 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  30.1 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  35.56 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  33.05 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  35.35 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  37.85 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  40.1 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  39.05 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  30.6 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1230  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00011378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1352  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0938  protein of unknown function DUF152  37.04 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1918  protein of unknown function DUF152  36.76 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.396331  normal  0.0287676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  33.77 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  36.69 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0513  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000314436  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  35.29 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  29.44 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  36.09 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  29.44 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  37.58 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  28.28 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  37.7 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  27.94 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  35.5 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  35.55 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  35.47 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  36.63 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  29.69 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  22.71 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  31.84 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  34.32 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  34.42 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  34.62 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  35.36 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  28.89 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  30.56 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.18 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  33.91 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  38.36 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  34.91 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  35.88 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  36.05 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  31.42 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  32.56 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.16 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1590  protein of unknown function DUF152  34.56 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840086  normal  0.0159691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  33.96 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1452  protein of unknown function DUF152  28.18 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000217835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  31.28 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  38.24 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  29.51 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>