More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0724 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1639  hypothetical protein  69.81 
 
 
275 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0922567  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07731  hypothetical protein  64.21 
 
 
284 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0346  hypothetical protein  45.2 
 
 
259 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05311  hypothetical protein  38.31 
 
 
260 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.773541  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3353  hypothetical protein  40.23 
 
 
278 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000198668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4846  protein of unknown function DUF152  39.63 
 
 
272 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1144  protein of unknown function DUF152  40.73 
 
 
282 aa  185  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570769  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2769  protein of unknown function DUF152  39.62 
 
 
276 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3333  protein of unknown function DUF152  39.62 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.586803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2759  hypothetical protein  39.53 
 
 
258 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.291456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1419  hypothetical protein  39.85 
 
 
259 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05921  hypothetical protein  30.8 
 
 
260 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0528  hypothetical protein  28.69 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  39.41 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  43.98 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  31.43 
 
 
276 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  34.48 
 
 
283 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  34.48 
 
 
265 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.9 
 
 
266 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  31.4 
 
 
264 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05841  hypothetical protein  29.29 
 
 
195 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  35.75 
 
 
257 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  37.08 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  30.64 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  30.3 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  38.12 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  34.66 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  33.14 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  34.43 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  33.14 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  35.75 
 
 
267 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  30.13 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  32.18 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  35.23 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.71 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  35.75 
 
 
255 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  35.08 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  32.96 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.44 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  34.31 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  33.04 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  33.61 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  37.1 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  32.23 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  32.8 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  40.56 
 
 
229 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.2 
 
 
244 aa  92  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  37.14 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  29.41 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  35.59 
 
 
256 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05541  hypothetical protein  27.53 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  38.89 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  31.84 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  32.09 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  30.69 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  31.12 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.14 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  36.7 
 
 
252 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.88 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  35.8 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  34.83 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  38.36 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  29.36 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  36.93 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  36.93 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  29.51 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  34.57 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  36.93 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  32.62 
 
 
228 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  33 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  37.85 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  36.71 
 
 
254 aa  86.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  32.42 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  32.16 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  32.96 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  34.41 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  34.05 
 
 
285 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.75 
 
 
242 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  34.84 
 
 
248 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  31.62 
 
 
259 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  36.57 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  33.87 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  32.62 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  30.82 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  37.14 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.77 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  30.73 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.77 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  29.81 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  33.7 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  32.51 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  35.75 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  35.22 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  36.78 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>