More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0346 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0346  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2769  protein of unknown function DUF152  50.39 
 
 
276 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1144  protein of unknown function DUF152  50.18 
 
 
282 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3333  protein of unknown function DUF152  50 
 
 
276 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.586803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3353  hypothetical protein  50.59 
 
 
278 aa  246  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000198668  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2759  hypothetical protein  49.22 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.291456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4846  protein of unknown function DUF152  48.45 
 
 
272 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1419  hypothetical protein  48.06 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07731  hypothetical protein  44.96 
 
 
284 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1639  hypothetical protein  46.03 
 
 
275 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0922567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  45.2 
 
 
262 aa  192  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05311  hypothetical protein  39.04 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.773541  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05921  hypothetical protein  29.31 
 
 
260 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  34.66 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  36.45 
 
 
263 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  34.26 
 
 
252 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0528  hypothetical protein  28.45 
 
 
265 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05841  hypothetical protein  30.94 
 
 
195 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  35.64 
 
 
263 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  33.96 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  32.85 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  36.07 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  36.07 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  36.07 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.5 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  33.17 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05541  hypothetical protein  31.28 
 
 
189 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.96 
 
 
255 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.68 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  33.16 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  33 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  29.13 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34.41 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  31.44 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  33.66 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  34.67 
 
 
244 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  28.64 
 
 
264 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  32.26 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  28.85 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  31.22 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  34.04 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  35.26 
 
 
271 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  30.27 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  34.59 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  32.41 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.68 
 
 
242 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  33.7 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  29.45 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.14 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  29.63 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  29.32 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  27.46 
 
 
264 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  33.15 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  30.85 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  34.05 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  34.24 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  34.04 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  33.15 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  27.94 
 
 
269 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  35.48 
 
 
235 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  35.48 
 
 
235 aa  86.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  33.15 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  35 
 
 
241 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  31.68 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.22 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  33.15 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.83 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  29.74 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  34.76 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  32.79 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  28.41 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  28.83 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  33.15 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  26.97 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.83 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.15 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  32.68 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  33.16 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.5 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  29.84 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  27 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  30.25 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  27 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  28.79 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  29.95 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  29.95 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  28.06 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>