More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1639 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1639  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0922567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  69.81 
 
 
262 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07731  hypothetical protein  63.2 
 
 
284 aa  354  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05311  hypothetical protein  40.73 
 
 
260 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.773541  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2769  protein of unknown function DUF152  41.92 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3333  protein of unknown function DUF152  41.92 
 
 
276 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.586803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1144  protein of unknown function DUF152  43.27 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570769  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0346  hypothetical protein  46.03 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3353  hypothetical protein  40.47 
 
 
278 aa  194  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000198668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4846  protein of unknown function DUF152  39.63 
 
 
272 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2759  hypothetical protein  38.37 
 
 
258 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.291456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1419  hypothetical protein  39.62 
 
 
259 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05921  hypothetical protein  30.8 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0528  hypothetical protein  27.8 
 
 
265 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05841  hypothetical protein  31.16 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  32.2 
 
 
276 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05541  hypothetical protein  31.35 
 
 
189 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  40.1 
 
 
241 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  31.32 
 
 
259 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  29.13 
 
 
264 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  28.93 
 
 
263 aa  98.6  9e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  31.62 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.03 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  30.05 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  29.23 
 
 
255 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  31.32 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  31.32 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  30.69 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  30.05 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  30.17 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  33.16 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  28.34 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  28.34 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  33.53 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  34.55 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  30.81 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  34.55 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  31.89 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  29.25 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  34.05 
 
 
229 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  31.66 
 
 
262 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  28 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.54 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  31.43 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  31.55 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  30 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  29.25 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  29.82 
 
 
251 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  27.31 
 
 
256 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  35.14 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  30.77 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  34.02 
 
 
252 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  29.59 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  31.75 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  29.1 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  30.21 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  32.47 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  29.82 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6287  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1792  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  30.57 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  31.98 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  30.41 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  31.25 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  33.85 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  33.73 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  34.73 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  33.16 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.88 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  35.14 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  34.48 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  30.65 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  27.96 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  28.25 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  33.15 
 
 
260 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  34.05 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  34.05 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  34.05 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  32.24 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  30.13 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  27.89 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  33.73 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  30.15 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  29.29 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  26.2 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  30.21 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  30.53 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  31.25 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  25.2 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  29.32 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  31.89 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.86 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>