More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4306 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  60.5 
 
 
238 aa  275  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  57.02 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  56.33 
 
 
228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  51.72 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  49.57 
 
 
239 aa  204  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  46.15 
 
 
249 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.72 
 
 
234 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  44.2 
 
 
224 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  42.86 
 
 
230 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  48 
 
 
255 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  44.74 
 
 
243 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  43.56 
 
 
227 aa  152  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  38.86 
 
 
253 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  40.27 
 
 
229 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  39.39 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  41.13 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  44.4 
 
 
274 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  42.29 
 
 
228 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.56 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  40.43 
 
 
235 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  41.67 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  38.1 
 
 
236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  39.42 
 
 
283 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.08 
 
 
255 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  43.36 
 
 
241 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  39.15 
 
 
231 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  49.46 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  39 
 
 
259 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  39.09 
 
 
250 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13560  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.07 
 
 
273 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.9 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  40.17 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.9 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.22 
 
 
232 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  32.71 
 
 
239 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  35.08 
 
 
265 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  34.22 
 
 
233 aa  105  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  28.07 
 
 
263 aa  104  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  37.05 
 
 
255 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  37.24 
 
 
254 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  38.22 
 
 
255 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  34.6 
 
 
264 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  37.11 
 
 
276 aa  101  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  37.17 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  35.53 
 
 
255 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  34.32 
 
 
240 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  38.57 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.55 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  36.13 
 
 
255 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  36.65 
 
 
255 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  32.5 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  25.84 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.95 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  35.44 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  37.63 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  38.15 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  30.12 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  37.66 
 
 
326 aa  95.5  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  36.12 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  34.18 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  35.38 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  35.35 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  35.23 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  35.08 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  35.23 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.23 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  36.55 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  41.41 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  32.47 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.61 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.84 
 
 
266 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  27.04 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.18 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  31.85 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  29.38 
 
 
214 aa  92.8  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  31.85 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  31.23 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  33.05 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.64 
 
 
274 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  40.61 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  34.2 
 
 
258 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  32.61 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  30.83 
 
 
262 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  33.5 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  35.64 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  35.9 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  29.73 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  31.8 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  25.21 
 
 
229 aa  89  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  28.81 
 
 
242 aa  89  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  31.62 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.13 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  28.18 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  35.78 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>