More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4799 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  100 
 
 
256 aa  530  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  52.5 
 
 
248 aa  255  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  42.8 
 
 
255 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  40.57 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  38.84 
 
 
272 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  40.96 
 
 
256 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  41.98 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  40.41 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  39.26 
 
 
253 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  37.19 
 
 
263 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  39.13 
 
 
253 aa  164  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.2 
 
 
268 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  36.82 
 
 
277 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  35.74 
 
 
267 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  36.99 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  36.18 
 
 
266 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  34.14 
 
 
267 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 
252 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.96 
 
 
266 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.4 
 
 
252 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.86 
 
 
264 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.86 
 
 
264 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  37.18 
 
 
270 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  35.39 
 
 
265 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.96 
 
 
274 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.14 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  36.4 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.54 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.16 
 
 
263 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  33.19 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  33.85 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  37.38 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  34.14 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  35.22 
 
 
241 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  31.62 
 
 
293 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  34.65 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  32.03 
 
 
275 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  33.81 
 
 
299 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  31.95 
 
 
283 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  36.04 
 
 
264 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  30.95 
 
 
272 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  32.13 
 
 
278 aa  122  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  122  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  34.44 
 
 
255 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  40.88 
 
 
255 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  34.87 
 
 
265 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.78 
 
 
270 aa  121  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  33.75 
 
 
272 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  36.04 
 
 
276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.92 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  40.45 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  39.78 
 
 
255 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  33.48 
 
 
254 aa  118  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  36.32 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.22 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  33.95 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  35.74 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.51 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  32.57 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  34.8 
 
 
233 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.23 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  34.38 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  32.18 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  35.56 
 
 
239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  33.76 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 
255 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  33.19 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  34.18 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08900  hypothetical protein  34.04 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000429341  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  29.92 
 
 
272 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  34.58 
 
 
253 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  34.01 
 
 
243 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.42 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  38.42 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  32 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  29.53 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.53 
 
 
272 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  36.51 
 
 
255 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  34.98 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  35.09 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  33.6 
 
 
243 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  36.36 
 
 
257 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.13 
 
 
272 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  34.98 
 
 
247 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.6 
 
 
243 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  33.46 
 
 
278 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>