More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1452 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1452  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 210 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000217835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0323  protein of unknown function DUF152  39.66 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.55 
 
 		 241 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  29.9 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  33.15 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  34.38 
 
 		 262 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  32.49 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  98.2  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  33.55 
 
 		 257 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  30.69 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  33 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  29.53 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  30.48 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  30.73 
 
 		 261 aa  95.5  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  27.14 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  27.52 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  29.53 
 
 		 240 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  33.75 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  30.92 
 
 		 244 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  30.3 
 
 		 252 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  27.98 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  31.28 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  30.1 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  28 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  30.1 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  32.14 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  32.57 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  27.98 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  28.07 
 
 		 254 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  28.93 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  29.89 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  32 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  30.69 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  27 
 
 		 246 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  29.61 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  25.77 
 
 		 246 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  26.29 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  25.77 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  29.89 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  30.18 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2821  hypothetical protein  34.36 
 
 		 238 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000917189  decreased coverage  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.15 
 
 		 279 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  30.65 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  30.18 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  26.89 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  29.06 
 
 		 272 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  28.3 
 
 		 285 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  29.75 
 
 		 268 aa  85.1  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  29.35 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  29.38 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  32.24 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  26.89 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  28.35 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  26.8 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  26.79 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  27.18 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  30.29 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  30.89 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  29.65 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  35.2 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  31.91 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  29.78 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  27.59 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  29.34 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1444  hypothetical protein  32.04 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  31.85 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  27.55 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  28.64 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  31.25 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  27.69 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  30.17 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  31.63 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  32.65 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  27.69 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.08 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08900  hypothetical protein  29.29 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000429341  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  28.08 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  26.57 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  29.14 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  32.16 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  29.22 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  31.55 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1100  conserved hypothetical protein (DUF152 domain protein)  28.65 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>