More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2821 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2821  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000917189  decreased coverage  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1661  hypothetical protein  59.04 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000830855  normal  0.376389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2473  hypothetical protein  57.65 
 
 		 257 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0424084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2377  hypothetical protein  57.25 
 
 		 257 aa  293  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.52116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  39.34 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  36.93 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  32.66 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  36.04 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  32.47 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  37.02 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  34.3 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  35.36 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  38.2 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  37.02 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  34.18 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  37.02 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  33.93 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.87 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  39.16 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  37.36 
 
 		 269 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  32.04 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  35.63 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  36.31 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.07 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  38.79 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  35.06 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  32.27 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  33.51 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  34.36 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  36.36 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  95.1  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  30.1 
 
 		 242 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  32.02 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  34.43 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  35.33 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.95 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.95 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  32.41 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.93 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  33.88 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  33.88 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  29.44 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  33.88 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  35.33 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  37.08 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  30.42 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  35.68 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  31.25 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  35.64 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  34.24 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  34.41 
 
 		 264 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  34.88 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  33.15 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  33.82 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  33.16 
 
 		 265 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  32.63 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  32.63 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  32.63 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.34 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  32.04 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45440  hypothetical protein  37.24 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  35.15 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  32.79 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  32.8 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  30.12 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  36.6 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  35.43 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  35.8 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  35.96 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  30.41 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  35.96 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.29 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  32.63 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  31.89 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  36.93 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3857  hypothetical protein  30 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  34.97 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  31.44 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  35.15 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.96 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  35.59 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  37.14 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  33.53 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>