More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1078 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1078  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 251 aa  507  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.425689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.49 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  37.12 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  36.93 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  37.87 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  35.83 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  39.32 
 
 		 251 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  33.73 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  32.49 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  34.02 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  34.18 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  38.57 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  33.48 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  37.29 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.67 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  30.94 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  26.96 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  32.51 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  33.74 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  31.47 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  34.3 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  33.63 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  36.4 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  31.06 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  35.32 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  31.38 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  31.72 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.62 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  34.98 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  32.37 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  31.74 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  32.74 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  35.44 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  34.53 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  32.13 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3059  hypothetical protein  35.65 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0765579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.84 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  32.96 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  27.85 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  34.29 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  33.62 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  34.96 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  26.87 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  30.04 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  28.18 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  30.04 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  32.19 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  32.08 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  32.08 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  35.19 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  25.93 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  31.03 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  33.05 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  30.29 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  27.93 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  31.02 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  33.76 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  32.92 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  30.08 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  29.18 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  29.88 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  30.34 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  30.74 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  27.9 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  29.2 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  29 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  32.02 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  28.44 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  29.05 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  29.31 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  31.53 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  31.02 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  30.96 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  30.51 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  28.75 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  27.56 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  28.83 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  28.75 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  29.41 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  28.7 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  33.47 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  28.82 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  28.32 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  29.15 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  29.18 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0490  protein of unknown function DUF152  29.86 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000444061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  29.18 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  31.93 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  31.93 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  31.93 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  27.05 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  29.26 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  29.27 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  29.29 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>