More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5759 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5759  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  70.04 
 
 		 234 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  65.2 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  62.56 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  60.79 
 
 		 229 aa  248  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3263  hypothetical protein  59.29 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3252  hypothetical protein  59.29 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3314  hypothetical protein  59.29 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3258  protein of unknown function DUF152  62.39 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.373021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5093  hypothetical protein  53.3 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196567  hitchhiker  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2992  hypothetical protein  60.18 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611604  normal  0.033024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  51.1 
 
 		 238 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12179  hypothetical protein  57.52 
 
 		 250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.376806  normal  0.713788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  52.65 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1419  hypothetical protein  50.88 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0337019  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  51.32 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3797  protein of unknown function DUF152  54.87 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.424236  normal  0.70382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  51.1 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  49.57 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  46.22 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  47.56 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1288  protein of unknown function DUF152  49.37 
 
 		 274 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4306  hypothetical protein  42.29 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  43.53 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3195  protein of unknown function DUF152  49.56 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0539561  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  43.91 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  43.91 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  42.24 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2406  protein of unknown function DUF152  44.98 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16530  hypothetical protein  40.79 
 
 		 283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.039671  normal  0.0289656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  41.63 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  43.66 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.95 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  37.93 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1574  hypothetical protein  42.01 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.436544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  40.95 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1599  protein of unknown function DUF152  45.02 
 
 		 251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.149332  normal  0.694465 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  39.66 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  39.66 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  39.57 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0215  uncharacterized protein, YfiH family  40.71 
 
 		 321 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  40.09 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  42.54 
 
 		 243 aa  134  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  37.66 
 
 		 263 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.24 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  36.56 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  39.47 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1083  hypothetical protein  38.86 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  38.89 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  34.48 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  39.47 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  36.32 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  40.57 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  41.3 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  38.1 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1906  hypothetical protein  36.4 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000349044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  40.17 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  39.17 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  44.4 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  34.5 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  37.08 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  40.09 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  38 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  38.17 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  39.15 
 
 		 254 aa  124  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  37.77 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  36.97 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  36.52 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  37.66 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  39.74 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  39.15 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  39.47 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  39.74 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  37.76 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  37.55 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  37.86 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  42.24 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  42.24 
 
 		 250 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  38.37 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  39.04 
 
 		 243 aa  121  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  36.32 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  37.87 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0554  hypothetical protein  35.11 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.13428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>