More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1578 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0230  hypothetical protein  98.4 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  88.8 
 
 		 250 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  67.59 
 
 		 255 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  66.53 
 
 		 252 aa  333  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  63.53 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  65.85 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  59.18 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  59.17 
 
 		 255 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  56.35 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  59.32 
 
 		 265 aa  267  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  58.05 
 
 		 283 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  57.5 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  58.05 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  57.08 
 
 		 255 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  54.33 
 
 		 255 aa  264  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  56.63 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  55.82 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  55.42 
 
 		 264 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  56.72 
 
 		 276 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  53.97 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  56.61 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3533  hypothetical protein  54.17 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  54.22 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  55.27 
 
 		 261 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  57.26 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  56.85 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  46.03 
 
 		 263 aa  232  6e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  54.36 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  51.43 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  51.98 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  48.22 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  51.45 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  48.82 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4772  hypothetical protein  55.02 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00107349  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  50.21 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  50.2 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1091  protein of unknown function DUF152  54.03 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.247412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1128  hypothetical protein  37.8 
 
 		 278 aa  186  2e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.390835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0672  hypothetical protein  48.35 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  43.95 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  41.44 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  40.78 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  43.75 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  42.06 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  41.45 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  42.06 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  41.53 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  41.63 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  41.27 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  41.63 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  41.63 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  41.2 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  41.63 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  40.52 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  40.77 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  40.34 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  41.2 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  40.34 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  35.32 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  40.34 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  41.78 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6259  protein of unknown function DUF152  42.47 
 
 		 228 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  35.34 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  35.66 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  41.3 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  40.77 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  39.66 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  40.08 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  41.78 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  39.66 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  39.29 
 
 		 272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  43.1 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  33.86 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  39.66 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  35.15 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  38.08 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2806  hypothetical protein  37.13 
 
 		 276 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  hitchhiker  0.00000205022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  42.99 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  41.2 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  34.91 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  36.74 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  40.89 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  40.83 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  38.78 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.48 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  37.21 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  41.3 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2089  hypothetical protein  40.76 
 
 		 273 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.21 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  40.38 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  40.38 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  41.59 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  37.82 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  39.57 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  39.24 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  38.75 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>