More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2317 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2317  protein of unknown function DUF152  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2619  hypothetical protein  71.54 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0794  protein of unknown function DUF152  61.02 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  61.11 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1061  protein of unknown function DUF152  52.63 
 
 		 259 aa  265  8e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.485211  normal  0.0827688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0693  protein of unknown function DUF152  53.47 
 
 		 245 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0819633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  38.4 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  41.28 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  40.85 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  38.26 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  40.43 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  36.9 
 
 		 254 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2852  hypothetical protein  31.94 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  34.94 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  38.26 
 
 		 285 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  36.65 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  37.45 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  36.18 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.93 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  37.2 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  33.98 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.05 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  37.05 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  36.33 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  35.37 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  38.25 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  36.03 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  38.25 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  36.9 
 
 		 243 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  35.63 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  35.63 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  35.63 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  35.63 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  34.92 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  35.04 
 
 		 242 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.06 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.48 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  34.94 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  37.64 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  35.5 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  34.57 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  37.45 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  34.96 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  37.7 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  34.96 
 
 		 243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.48 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  36.99 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  34.55 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  33.96 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  33.58 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  33.94 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  34.55 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  33.74 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  34.51 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  33.06 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  34.69 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  36.12 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  35.32 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  33.86 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  32.81 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  32.81 
 
 		 241 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  34.55 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  38.43 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  35.46 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1871  hypothetical protein  38.62 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  33.93 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  34.43 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  34.4 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  35.27 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  34.66 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  38.3 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  36.29 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  36.8 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  33.98 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  35.77 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  35.37 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  30.6 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  35.25 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  37.11 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  36.99 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  37.18 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  37.86 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  33.06 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  34.84 
 
 		 229 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  31.91 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  31.35 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  37.55 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  31.8 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.06 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  33.83 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  32.27 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  36.03 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  32.43 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  34.66 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  35.97 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  27.89 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  33.06 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  34.24 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>