More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1729 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  98.29 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  28.69 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  29.82 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  34.25 
 
 
270 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  35.29 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  31.08 
 
 
267 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  31.47 
 
 
267 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  29.95 
 
 
265 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  32.58 
 
 
279 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  29.76 
 
 
254 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  34.65 
 
 
240 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  30.63 
 
 
266 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1488  protein of unknown function DUF152  32.73 
 
 
264 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  30.37 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  33.5 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  32.8 
 
 
271 aa  99  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  29.57 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  31.51 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  30.53 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  32.7 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0479  hypothetical protein  31.52 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.781754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  25.69 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  35.29 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  33.94 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  29.52 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  26.87 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  29.17 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  30.77 
 
 
252 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.09 
 
 
299 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  32.62 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  30.77 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  30.56 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1763  hypothetical protein  41.03 
 
 
242 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  30.06 
 
 
270 aa  92  7e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  29.68 
 
 
260 aa  91.7  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  27.73 
 
 
263 aa  91.7  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  30.7 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  29.56 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  30.27 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  29.35 
 
 
293 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  29.59 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  33.73 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0713  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1240  protein of unknown function DUF152  30.19 
 
 
237 aa  89  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  28.64 
 
 
251 aa  89  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1824  protein of unknown function DUF152  29.74 
 
 
224 aa  89  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  31.63 
 
 
255 aa  89  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  27.61 
 
 
273 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0279  hypothetical protein  31.43 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.300917  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  24.07 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  28.23 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  35.26 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0596  protein of unknown function DUF152  26.78 
 
 
241 aa  87  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  28.37 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0901  protein of unknown function DUF152  28.04 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  28.21 
 
 
255 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  34.76 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  32.32 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  28.5 
 
 
240 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  29.41 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  31.36 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  30.19 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  25.83 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.16 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  31.48 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  29.38 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2437  protein of unknown function DUF152  30.1 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000259762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1133  protein of unknown function DUF152  28.17 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0471176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  29.63 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  30.96 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  28.87 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  27.59 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2473  hypothetical protein  33.11 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0424084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1661  hypothetical protein  33.11 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000830855  normal  0.376389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  28.81 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2377  hypothetical protein  33.11 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.52116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  28.66 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  28.66 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  27.73 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  27.36 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  25.95 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  25.95 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6103  protein of unknown function DUF152  28.86 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.088522  normal  0.080286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.66 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0996  hypothetical protein  31 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.063722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  27.41 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.66 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  28.66 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  30.77 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.71 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  29.94 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  28.66 
 
 
272 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  28.66 
 
 
272 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0323  protein of unknown function DUF152  31.95 
 
 
190 aa  82  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  27.98 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  29.72 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  29 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>