More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2101 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2101  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 311 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2228  polyprenyl synthetase  61.39 
 
 		 360 aa  360  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1935  farnesyl-diphosphate synthase  61.17 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  47.69 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.81 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  42.72 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  41.49 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  44.87 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  43.42 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  45.1 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  42.95 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  44.2 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 293 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  44.24 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  44.24 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  44.24 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.68 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  45.64 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  48.8 
 
 		 294 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 299 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  44.53 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.3 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  39.33 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  40.69 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  43.01 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  42.65 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  42.29 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.02 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41.45 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.21 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 294 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  44.28 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  40.39 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  45.22 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  45.09 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.91 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  44.36 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  41.79 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2241  polyprenyl synthetase  44.36 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  41.02 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  41.07 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  39.41 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2876  polyprenyl synthetase  45.38 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  39.47 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  39.47 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  47.54 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  45.36 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  44.48 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  38.62 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  40.86 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  37.97 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  46.8 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  41.99 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  41.84 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  41.4 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  44.86 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  40.86 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2512  polyprenyl synthetase  36.67 
 
 		 335 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  44.8 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  39.42 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  39.42 
 
 		 306 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  39.87 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0955  Polyprenyl synthetase  45.14 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  45.73 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  45.73 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  39.07 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  45.73 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  45.45 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  45.55 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  42.7 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  36.39 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  45.45 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  43.73 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  46.13 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>