More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2865 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.2 
 
 		 721 aa  1245    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3950  methyl-accepting chemotaxis transducer  84.34 
 
 		 725 aa  1246    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2916  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.95 
 
 		 713 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 722 aa  1491    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.370999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.78 
 
 		 713 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1316  chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0285504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  39.36 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  36.68 
 
 		 549 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 676 aa  171  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 822 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.89 
 
 		 632 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 533 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.73 
 
 		 533 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 547 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 543 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 538 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  34.71 
 
 		 544 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  38.21 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.77 
 
 		 547 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 		 661 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 		 547 aa  152  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 533 aa  151  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 545 aa  150  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  37.09 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  35.09 
 
 		 559 aa  147  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.76 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 		 544 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 636 aa  146  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  33.95 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 540 aa  145  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 570 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.31 
 
 		 541 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001273  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 638 aa  144  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 550 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.99 
 
 		 650 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.33 
 
 		 546 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  28.74 
 
 		 629 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.49 
 
 		 673 aa  142  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 		 554 aa  142  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 546 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 639 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 739 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 		 535 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 540 aa  140  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 535 aa  140  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 550 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.18 
 
 		 558 aa  140  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.45 
 
 		 628 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.4 
 
 		 546 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  34.66 
 
 		 549 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  35.71 
 
 		 541 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.24 
 
 		 624 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.87 
 
 		 668 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 625 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.7 
 
 		 640 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  28.54 
 
 		 629 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 542 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.04 
 
 		 539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0163835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.32 
 
 		 677 aa  138  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  35.33 
 
 		 645 aa  138  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  32.13 
 
 		 392 aa  138  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.95 
 
 		 624 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 638 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.95 
 
 		 624 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.76 
 
 		 650 aa  137  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 423 aa  137  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 668 aa  137  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.05 
 
 		 643 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  30.75 
 
 		 554 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 716 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 		 532 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  32.38 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  35.86 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 532 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 554 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 658 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.5 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.37 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  31.05 
 
 		 539 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.76 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  32.94 
 
 		 712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  31 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.29 
 
 		 627 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 673 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  28.6 
 
 		 712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  31.73 
 
 		 629 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>