More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1316 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1316  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 704 aa  1459    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0285504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2916  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 713 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 		 713 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2865  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 722 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.370999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3950  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.28 
 
 		 725 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1872  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 721 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.43 
 
 		 679 aa  124  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.03 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.57 
 
 		 660 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.69 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  26.44 
 
 		 713 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 530 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 		 666 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.54 
 
 		 532 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 532 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 		 533 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.54 
 
 		 739 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.45 
 
 		 547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 661 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.38 
 
 		 822 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  26.24 
 
 		 543 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  26.29 
 
 		 625 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.67 
 
 		 1079 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  26.49 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.22 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 546 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 		 549 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4362  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 		 445 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138074  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.63 
 
 		 564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  27.54 
 
 		 666 aa  111  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.95 
 
 		 716 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.93 
 
 		 539 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.53 
 
 		 546 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 		 686 aa  111  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.93 
 
 		 695 aa  111  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 652 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  25.5 
 
 		 712 aa  111  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.95 
 
 		 478 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.53 
 
 		 627 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  26.4 
 
 		 666 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  29.39 
 
 		 621 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2111  aerotaxis receptor Aer-2  27.59 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0317394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  27.54 
 
 		 666 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 680 aa  110  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.93 
 
 		 640 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.55 
 
 		 533 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 569 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  28.4 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.11 
 
 		 564 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 660 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 538 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3770  aerotaxis receptor Aer  25.14 
 
 		 521 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.7 
 
 		 658 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 		 528 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  25.21 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.27 
 
 		 539 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3066  chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 488 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.301784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.59 
 
 		 521 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.976535  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  28.12 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  26.58 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  26.87 
 
 		 633 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0529  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  28.17 
 
 		 677 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  25.22 
 
 		 550 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 541 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  26.27 
 
 		 715 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25.63 
 
 		 646 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.68 
 
 		 521 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0442  methyl-accepting chemotaxis protein  28.27 
 
 		 580 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.47 
 
 		 541 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4882  methyl-accepting chemotaxis protein  28.27 
 
 		 580 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  27.63 
 
 		 658 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 		 630 aa  107  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  28.03 
 
 		 680 aa  107  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56843  normal  0.473301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.96 
 
 		 691 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.44 
 
 		 509 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 500 aa  107  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 		 668 aa  107  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  26.69 
 
 		 549 aa  107  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  25.93 
 
 		 658 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  27.63 
 
 		 658 aa  107  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  24.66 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  24.66 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  28.4 
 
 		 658 aa  107  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  29.58 
 
 		 544 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.13 
 
 		 528 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0086081  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  25.55 
 
 		 632 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  32.92 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  36.46 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.33 
 
 		 547 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.87 
 
 		 571 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 		 640 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  27.76 
 
 		 660 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  27.63 
 
 		 658 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>