125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3454 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3454  General secretory system II protein E domain protein  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.84 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 573 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  28.91 
 
 		 885 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  25.9 
 
 		 565 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  25.61 
 
 		 888 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  26.29 
 
 		 871 aa  62  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  29.01 
 
 		 553 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1797  response regulator receiver protein  26.03 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  25.35 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2420  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  26.79 
 
 		 557 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 572 aa  56.2  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  23.49 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  25.58 
 
 		 570 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  26.92 
 
 		 557 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  31.03 
 
 		 577 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 553 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 787 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  28.57 
 
 		 724 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  29.63 
 
 		 571 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 555 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  23.36 
 
 		 570 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  30.4 
 
 		 574 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 568 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  29.01 
 
 		 577 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  22.46 
 
 		 561 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  28.57 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  23.53 
 
 		 591 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.09 
 
 		 553 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 571 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.62 
 
 		 572 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  26.58 
 
 		 561 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 648 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  24.62 
 
 		 556 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 573 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.24 
 
 		 558 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 570 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4148  General secretory system II protein E domain protein  27.27 
 
 		 499 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00811827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4175  General secretory system II protein E domain protein  26.9 
 
 		 506 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.417025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 573 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1124  general secretion pathway protein E  28.7 
 
 		 1017 aa  49.7  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.553401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.13 
 
 		 570 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.13 
 
 		 570 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1638  type II secretion system protein E  22.45 
 
 		 644 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  36 
 
 		 550 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.06 
 
 		 568 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  25.23 
 
 		 569 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0349  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000754733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.23 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.03 
 
 		 569 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  25.93 
 
 		 552 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 638 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  31.43 
 
 		 574 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 569 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4032  general secretory system II, protein E-like  26.21 
 
 		 478 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.23 
 
 		 569 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.23 
 
 		 569 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.3 
 
 		 569 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  25.53 
 
 		 558 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.32 
 
 		 570 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  26.72 
 
 		 564 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  28.43 
 
 		 578 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3335  general secretory system II, protein E-like  27.14 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0137168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  24.4 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  26.43 
 
 		 370 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  25.34 
 
 		 562 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.51 
 
 		 577 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.48 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.48 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  26.45 
 
 		 611 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  25 
 
 		 891 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  25.17 
 
 		 563 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  24.67 
 
 		 574 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  22.08 
 
 		 561 aa  45.8  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  24.3 
 
 		 568 aa  45.4  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  22.73 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.85 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25 
 
 		 578 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.23 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  33.01 
 
 		 520 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 576 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.3 
 
 		 569 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.23 
 
 		 568 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.3 
 
 		 569 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3416  General secretory system II protein E domain protein  25.71 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 626 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  24.44 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  26.96 
 
 		 611 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  26.96 
 
 		 611 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3480  General secretory system II protein E domain protein  25.71 
 
 		 181 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  25.56 
 
 		 559 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  22.14 
 
 		 566 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  27.42 
 
 		 594 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  24.68 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.19 
 
 		 703 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  25.55 
 
 		 561 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>