86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0463 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  100 
 
 		 542 aa  1118    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.8 
 
 		 545 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.21 
 
 		 552 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.62 
 
 		 541 aa  532  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  54.84 
 
 		 542 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  59.38 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  51.07 
 
 		 549 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.98 
 
 		 552 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  53.98 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  54.73 
 
 		 548 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  54.73 
 
 		 548 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  54.73 
 
 		 548 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  54.73 
 
 		 548 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.76 
 
 		 548 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.27 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.76 
 
 		 550 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.37 
 
 		 554 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  55.51 
 
 		 554 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  55.46 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  53.55 
 
 		 547 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.12 
 
 		 542 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  55.08 
 
 		 554 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  52.04 
 
 		 542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  51.11 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  54.37 
 
 		 537 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  53.08 
 
 		 532 aa  511  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  51.06 
 
 		 556 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.79 
 
 		 554 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.32 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.57 
 
 		 553 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  50.39 
 
 		 539 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  47.42 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  52.12 
 
 		 550 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  49.57 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  43.94 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  45.08 
 
 		 865 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.69 
 
 		 764 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  38.37 
 
 		 803 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  42.73 
 
 		 1154 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  37.44 
 
 		 790 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.14 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.03 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  27.07 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.33 
 
 		 360 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.23 
 
 		 353 aa  54.3  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.47 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.36 
 
 		 329 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.62 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.28 
 
 		 353 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.36 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.27 
 
 		 378 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.84 
 
 		 373 aa  51.6  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.68 
 
 		 349 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.99 
 
 		 383 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.42 
 
 		 323 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.02 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.53 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.79 
 
 		 349 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.27 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.02 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  24.35 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  23.43 
 
 		 364 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  23.33 
 
 		 370 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3191  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.71 
 
 		 492 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  28.52 
 
 		 359 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.71 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  22.26 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.68 
 
 		 378 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  25.85 
 
 		 317 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.18 
 
 		 376 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  24.13 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.15 
 
 		 492 aa  47  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.07 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  20.15 
 
 		 376 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  25.19 
 
 		 364 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.44 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.02 
 
 		 506 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.63 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.37 
 
 		 353 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.57 
 
 		 354 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  25.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  22.74 
 
 		 364 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  22.74 
 
 		 364 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  22.83 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  24.39 
 
 		 326 aa  43.5  0.01  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>