46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0687 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 		 530 aa  1092    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  54.78 
 
 		 539 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.21 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.21 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.11 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.11 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  49.68 
 
 		 545 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  50.76 
 
 		 542 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.46 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50 
 
 		 550 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50 
 
 		 548 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.02 
 
 		 554 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  46.43 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  48.64 
 
 		 548 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  48.85 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  48.85 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  48.85 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  49.28 
 
 		 542 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  50 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.45 
 
 		 554 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.64 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  46.79 
 
 		 532 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  47.42 
 
 		 542 aa  460  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.99 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  48.33 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  49.24 
 
 		 556 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  50.45 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  47.29 
 
 		 531 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  45.79 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  45.53 
 
 		 554 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  48.07 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.14 
 
 		 553 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  47.95 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  47.73 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  45.1 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.68 
 
 		 764 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  40.13 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  42.89 
 
 		 1154 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  44.37 
 
 		 865 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  35.6 
 
 		 790 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.72 
 
 		 369 aa  54.3  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.74 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.15 
 
 		 361 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  23.13 
 
 		 354 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.62 
 
 		 358 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.18 
 
 		 368 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>