43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3913 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.17 
 
 
541 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  71.32 
 
 
549 aa  816    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  100 
 
 
556 aa  1157    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  57.71 
 
 
548 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  57.03 
 
 
545 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  57.9 
 
 
548 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  57.74 
 
 
542 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  57.9 
 
 
548 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.9 
 
 
552 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  59.32 
 
 
545 aa  666    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  57.71 
 
 
548 aa  645    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.69 
 
 
548 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.78 
 
 
542 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.66 
 
 
550 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.3 
 
 
550 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  57.78 
 
 
547 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.77 
 
 
552 aa  934    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  58.89 
 
 
542 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  64.35 
 
 
525 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  55.6 
 
 
532 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  57.5 
 
 
537 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  56.24 
 
 
531 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  51.06 
 
 
542 aa  529  1e-149  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.11 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  48.05 
 
 
526 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  47.12 
 
 
550 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.88 
 
 
554 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.47 
 
 
554 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  45.91 
 
 
554 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  45.22 
 
 
557 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  49.28 
 
 
539 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  49.24 
 
 
530 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  45.53 
 
 
554 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  50.11 
 
 
477 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  44.93 
 
 
764 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  44.44 
 
 
481 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  43.98 
 
 
803 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  43.08 
 
 
1154 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  41.24 
 
 
865 aa  364  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  37.67 
 
 
790 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  38.1 
 
 
363 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  27 
 
 
353 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  38.1 
 
 
363 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>