More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6375 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 353 aa  712    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.3 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.94 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.68 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  43.57 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  43.19 
 
 		 364 aa  277  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  40.96 
 
 		 363 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  42.77 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  41.13 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  43.15 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  42.9 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  42.98 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  42.98 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  41.86 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  42.07 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.3 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  41.19 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.82 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.6 
 
 		 346 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.25 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.53 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.1 
 
 		 353 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.53 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.94 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.24 
 
 		 349 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.24 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.55 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.65 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.1 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.57 
 
 		 354 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  36.47 
 
 		 356 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  42.78 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  42.17 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.63 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.81 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.64 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.21 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.71 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.4 
 
 		 361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  39.88 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  39.17 
 
 		 359 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.69 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  38.51 
 
 		 347 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 		 366 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.26 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.75 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.85 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  38.51 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.32 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.3 
 
 		 346 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.03 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.9 
 
 		 366 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.07 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.84 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.23 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.29 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.24 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39 
 
 		 366 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.84 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.35 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.44 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.44 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.77 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.35 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.35 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.08 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.14 
 
 		 381 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3007  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.06 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.55 
 
 		 357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.99 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.6 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  39.1 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  39.71 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.11 
 
 		 348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.32 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.82 
 
 		 361 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.41 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.26 
 
 		 366 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  37.85 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.47 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.77 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.1 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.42 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.05 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.35 
 
 		 366 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.96 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.95 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.76 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.64 
 
 		 366 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  38.96 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.61 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.22 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.22 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.21 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  34.01 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.89 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.06 
 
 		 366 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>