More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3159 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  100 
 
 
366 aa  714    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  91.53 
 
 
366 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  91.26 
 
 
366 aa  590  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  91.53 
 
 
366 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  92.97 
 
 
327 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  92.97 
 
 
327 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.59 
 
 
359 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.99 
 
 
359 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  78.27 
 
 
359 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  70.62 
 
 
368 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.03 
 
 
360 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  71.1 
 
 
366 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.03 
 
 
360 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  77.03 
 
 
360 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  78.74 
 
 
358 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.81 
 
 
350 aa  339  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.73 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  54.91 
 
 
356 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  40.79 
 
 
364 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  40.79 
 
 
364 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.38 
 
 
378 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  40.57 
 
 
365 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  40.95 
 
 
364 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  43.6 
 
 
363 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.29 
 
 
363 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  40 
 
 
364 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  40 
 
 
364 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  40.95 
 
 
364 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  43.29 
 
 
363 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.3 
 
 
354 aa  275  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  40.91 
 
 
355 aa  269  7e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  42.03 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.23 
 
 
355 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.23 
 
 
355 aa  260  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.56 
 
 
351 aa  243  5e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  43.03 
 
 
347 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.56 
 
 
346 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.31 
 
 
354 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.71 
 
 
353 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.63 
 
 
363 aa  232  9e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.21 
 
 
362 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.86 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.76 
 
 
353 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.81 
 
 
364 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.75 
 
 
344 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.88 
 
 
376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.85 
 
 
351 aa  215  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.79 
 
 
360 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.29 
 
 
381 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.24 
 
 
361 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.92 
 
 
353 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  39.06 
 
 
359 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.75 
 
 
355 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.91 
 
 
366 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.23 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.55 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.13 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.92 
 
 
349 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.27 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.73 
 
 
361 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.75 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.13 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.92 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.61 
 
 
349 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.92 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.39 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.33 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.29 
 
 
357 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.61 
 
 
359 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  40.76 
 
 
351 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  40.49 
 
 
351 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  38.3 
 
 
359 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.39 
 
 
367 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02145  2-nitropropane dioxygenase  42.9 
 
 
356 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.74 
 
 
378 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.41 
 
 
358 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.82 
 
 
367 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 
358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  39.38 
 
 
358 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.33 
 
 
382 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  34.59 
 
 
356 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.38 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  40.85 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.09 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.27 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.85 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5205  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.36 
 
 
350 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.18 
 
 
371 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.55 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.64 
 
 
358 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.97 
 
 
366 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.04 
 
 
352 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.94 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.31 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  42.02 
 
 
350 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.12 
 
 
366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.12 
 
 
358 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.22 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  39.88 
 
 
362 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.28 
 
 
356 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>