More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2684 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 344 aa  691    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.64 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  53.3 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.27 
 
 		 353 aa  297  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.89 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.45 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  48.39 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.7 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.61 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  48.54 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.25 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.91 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.54 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.69 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.15 
 
 		 338 aa  252  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.54 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.54 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.4 
 
 		 363 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.54 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  40.17 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  40 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  39.89 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.83 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  39.89 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  40.06 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  39.61 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  39.61 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.98 
 
 		 346 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  39.94 
 
 		 363 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  40.84 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.62 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.62 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  37.61 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  47.11 
 
 		 351 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  42.07 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  46.22 
 
 		 351 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.63 
 
 		 386 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  38.35 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.35 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  43.23 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.98 
 
 		 357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.47 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.33 
 
 		 366 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.61 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.57 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.07 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.52 
 
 		 359 aa  205  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.6 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.52 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.1 
 
 		 353 aa  202  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.64 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.7 
 
 		 365 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  38.81 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.14 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.09 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.96 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.52 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.34 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.74 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.63 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.95 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  37.57 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.97 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.27 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.04 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.77 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.93 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.82 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  39.59 
 
 		 359 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.9 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.98 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.39 
 
 		 346 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.9 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.69 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.62 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.43 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.4 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.58 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.94 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.4 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.41 
 
 		 378 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.58 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.89 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.71 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.05 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.49 
 
 		 361 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.98 
 
 		 354 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  39.82 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.51 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.04 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.05 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  42.73 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.87 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.8 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.67 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.68 
 
 		 358 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.12 
 
 		 371 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.52 
 
 		 361 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>