More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1135 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  721    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  97.13 
 
 
355 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.28 
 
 
363 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  48 
 
 
363 aa  330  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.6 
 
 
350 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.29 
 
 
378 aa  329  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  48.86 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  48.14 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  48.15 
 
 
364 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  48.29 
 
 
365 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  49.27 
 
 
364 aa  322  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  48.55 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  47.71 
 
 
364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  47.71 
 
 
364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  44.02 
 
 
368 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.68 
 
 
359 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.35 
 
 
366 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.94 
 
 
355 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.94 
 
 
355 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.07 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.69 
 
 
359 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.95 
 
 
358 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.69 
 
 
359 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.5 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.5 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.12 
 
 
356 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.21 
 
 
366 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.1 
 
 
360 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.1 
 
 
360 aa  248  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.1 
 
 
360 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.4 
 
 
360 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.63 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.63 
 
 
327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.03 
 
 
366 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.96 
 
 
346 aa  236  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.96 
 
 
363 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  39.78 
 
 
347 aa  227  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.18 
 
 
356 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.92 
 
 
367 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.37 
 
 
354 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.59 
 
 
351 aa  222  6e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.71 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.81 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.17 
 
 
366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.65 
 
 
355 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.86 
 
 
361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.35 
 
 
354 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.24 
 
 
357 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.82 
 
 
381 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.83 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.6 
 
 
378 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.35 
 
 
344 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
344 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.86 
 
 
366 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.69 
 
 
376 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.81 
 
 
353 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.94 
 
 
358 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  36.81 
 
 
359 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.86 
 
 
366 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.81 
 
 
353 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.9 
 
 
351 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.38 
 
 
361 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.77 
 
 
366 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.81 
 
 
349 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.28 
 
 
350 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.19 
 
 
357 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 
350 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.69 
 
 
354 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.07 
 
 
352 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 
349 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.29 
 
 
366 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  39 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.77 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  39.48 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.35 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.49 
 
 
349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.42 
 
 
346 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  33.73 
 
 
344 aa  198  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.36 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  38.55 
 
 
352 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.97 
 
 
359 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  35.01 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.13 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.23 
 
 
354 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.68 
 
 
353 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.69 
 
 
382 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  35.1 
 
 
356 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02145  2-nitropropane dioxygenase  33.52 
 
 
356 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.29 
 
 
353 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.6 
 
 
380 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  34.29 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.65 
 
 
352 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.19 
 
 
354 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.34 
 
 
348 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 
358 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.62 
 
 
361 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.72 
 
 
358 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.12 
 
 
371 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.392208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>