More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1176 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 348 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.64 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.64 
 
 		 353 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.78 
 
 		 350 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.43 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.11 
 
 		 354 aa  329  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.27 
 
 		 366 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.82 
 
 		 366 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.98 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.41 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  55.88 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.14 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.98 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.62 
 
 		 367 aa  299  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  52.17 
 
 		 351 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  51.88 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3785  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.69 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109724  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.79 
 
 		 351 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.15 
 
 		 353 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.15 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.3 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  38.3 
 
 		 359 aa  215  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.15 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.86 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.69 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.15 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.71 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.86 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.13 
 
 		 365 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.84 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.28 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.52 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.11 
 
 		 353 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.3 
 
 		 352 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3007  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.82 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.6 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.44 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.41 
 
 		 350 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5205  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.81 
 
 		 350 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.1 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.24 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.68 
 
 		 358 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.97 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.13 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.95 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.75 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  36.31 
 
 		 348 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.48 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  34.09 
 
 		 355 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.84 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  37.46 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.92 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.96 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  37.72 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  32.54 
 
 		 356 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  34.38 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.65 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.46 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.07 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.68 
 
 		 353 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.72 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.84 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.84 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 		 356 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.71 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.2 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.25 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.25 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.95 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.84 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.84 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.74 
 
 		 363 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  32.76 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.76 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.85 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.91 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.39 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.82 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  31.99 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  33.52 
 
 		 359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.47 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.82 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  37.15 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.01 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56894  2-nitropropane dioxygenases  30.37 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  31.82 
 
 		 364 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.84 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.53 
 
 		 365 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  30.97 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  30.97 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.7 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.04 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  31.97 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.47 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.77 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.35 
 
 		 360 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>