More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3779 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
353 aa  677    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.27 
 
 
344 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.16 
 
 
338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  51.31 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.23 
 
 
340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  50.29 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.54 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.2 
 
 
340 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.69 
 
 
338 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  45.24 
 
 
343 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.24 
 
 
343 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.35 
 
 
349 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.86 
 
 
347 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  38.26 
 
 
364 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  38.26 
 
 
364 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.9 
 
 
345 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  38.64 
 
 
365 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  38.35 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  38.35 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.68 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  39.05 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  38.26 
 
 
363 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.19 
 
 
363 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  38.76 
 
 
364 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.94 
 
 
356 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  38.55 
 
 
363 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.84 
 
 
355 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
355 aa  206  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  39.29 
 
 
350 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.31 
 
 
351 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  37.94 
 
 
355 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.17 
 
 
386 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.12 
 
 
346 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.83 
 
 
346 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.41 
 
 
376 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  38.63 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.14 
 
 
349 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  42.61 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  43.34 
 
 
351 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.48 
 
 
367 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.18 
 
 
350 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.92 
 
 
353 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.86 
 
 
349 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.99 
 
 
357 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.81 
 
 
362 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.98 
 
 
340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.98 
 
 
340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.29 
 
 
349 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.98 
 
 
340 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.44 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.68 
 
 
353 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.57 
 
 
366 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.57 
 
 
349 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.43 
 
 
354 aa  189  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.57 
 
 
353 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  42.53 
 
 
362 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.36 
 
 
353 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.89 
 
 
356 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.89 
 
 
356 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.35 
 
 
361 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.18 
 
 
358 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.12 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.94 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.38 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  36.05 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.95 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.97 
 
 
354 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.03 
 
 
381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.89 
 
 
359 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.9 
 
 
366 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.34 
 
 
353 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.85 
 
 
351 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  38.57 
 
 
358 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.01 
 
 
348 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.09 
 
 
382 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.44 
 
 
366 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.55 
 
 
366 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.25 
 
 
354 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.69 
 
 
354 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.68 
 
 
359 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.82 
 
 
344 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  41.3 
 
 
361 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.83 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.03 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.61 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.75 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.3 
 
 
361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  43.2 
 
 
352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.11 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.18 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  36.36 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3007  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.52 
 
 
353 aa  172  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.01 
 
 
348 aa  171  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.91 
 
 
353 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.21 
 
 
360 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.84 
 
 
352 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.98 
 
 
356 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.52 
 
 
350 aa  169  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.14 
 
 
361 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.98 
 
 
356 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.688478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>