More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2277 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 340 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  73.67 
 
 		 340 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.48 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  52.35 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.61 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.23 
 
 		 353 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.62 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  50.15 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.38 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.11 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.99 
 
 		 343 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  42.69 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.25 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.51 
 
 		 347 aa  232  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.79 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.79 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.79 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.78 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.04 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.18 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  36.36 
 
 		 364 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  36.72 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.06 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  37.01 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  36.72 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  36.42 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  36.42 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  35.78 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  36.53 
 
 		 363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.44 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  37.13 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.39 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.39 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.94 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  37.43 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.43 
 
 		 351 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  34.53 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.43 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  34.23 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.72 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.88 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.81 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.47 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.02 
 
 		 354 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.21 
 
 		 350 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.78 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.86 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.36 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  36.2 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  34.87 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.87 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.72 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.96 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.28 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.32 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.76 
 
 		 351 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.84 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.23 
 
 		 361 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.11 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.34 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.01 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.67 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.01 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.3 
 
 		 353 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.76 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.62 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.01 
 
 		 349 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.65 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.39 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  32.65 
 
 		 356 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.67 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.67 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.39 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.73 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.31 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.37 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.86 
 
 		 351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.14 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.84 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.18 
 
 		 358 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.39 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.94 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  32.85 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.47 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.43 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  40.43 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.94 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.6 
 
 		 366 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.99 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.77 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.64 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.67 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.25 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.24 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.56 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.14 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>