More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  100 
 
 		 350 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1221  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.18 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.3 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3779  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.31 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4236  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.47 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2419  2-nitropropane dioxygenase NPD  51.93 
 
 		 338 aa  262  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.57961  normal  0.818937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.6 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.31 
 
 		 338 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  48.96 
 
 		 344 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4389  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2068  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.11 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2846  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.13 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0098  hypothetical protein  44.71 
 
 		 343 aa  233  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.71 
 
 		 343 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5043  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.87 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.55 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.94 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.21 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.21 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  39.09 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.24 
 
 		 351 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0500  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.66 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0489  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.66 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0511  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.66 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  36.21 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.83 
 
 		 363 aa  205  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.81 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  34.55 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  35.1 
 
 		 365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  34.9 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  35.03 
 
 		 364 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  34.82 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  34.82 
 
 		 364 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  34.82 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.71 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  34.92 
 
 		 363 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.34 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.34 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.32 
 
 		 376 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.66 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.75 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.6 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.84 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  32.39 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  33.14 
 
 		 350 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.61 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.94 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.23 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.41 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.53 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.53 
 
 		 366 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.83 
 
 		 366 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.96 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.1 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  41.24 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.4 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 		 354 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.02 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.59 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.99 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.42 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  39.14 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  34.68 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.51 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  38.86 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.06 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.06 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.13 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.64 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.99 
 
 		 378 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.57 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.79 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.31 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.74 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.53 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.51 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.92 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  34.33 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  35.52 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.69 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.8 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.04 
 
 		 349 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.63 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.63 
 
 		 349 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.39 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.51 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.64 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.64 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.64 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3596  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.72 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.886612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.2 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.78 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.82 
 
 		 358 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  34 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.81 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.21 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.5 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>