More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0392 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 		 366 aa  726    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  93.94 
 
 		 368 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  72.24 
 
 		 366 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  72.24 
 
 		 366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  72.24 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  71.1 
 
 		 366 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.64 
 
 		 359 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  69.58 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  74.38 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  74.38 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.58 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  70 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  69.72 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  70.32 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.51 
 
 		 350 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.97 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.12 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  45.18 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  42.22 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  43.67 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.88 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  41.94 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  41.94 
 
 		 364 aa  296  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.67 
 
 		 378 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  41.94 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  43.37 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  41.39 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  41.39 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  53.56 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  44.35 
 
 		 350 aa  272  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  43.3 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.99 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.99 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.33 
 
 		 346 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.26 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.29 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.79 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  40 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  39.83 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.12 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.38 
 
 		 351 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.23 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.46 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.64 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.88 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.67 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.72 
 
 		 344 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.47 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.48 
 
 		 359 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.34 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.63 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  42.61 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.77 
 
 		 367 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.19 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  42.33 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.09 
 
 		 360 aa  206  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  40.46 
 
 		 358 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.31 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.24 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.14 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.12 
 
 		 350 aa  203  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.57 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.17 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  42.02 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.41 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.34 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.45 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  42.33 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  43.1 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.76 
 
 		 354 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.48 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.17 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.46 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.17 
 
 		 349 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.66 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.06 
 
 		 349 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.36 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  36.92 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.76 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.25 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.27 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5205  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.76 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.62 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.15 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.46 
 
 		 357 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.39 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02145  2-nitropropane dioxygenase  38.64 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.13 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.74 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.51 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  34.31 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.5 
 
 		 354 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.7 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.99 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.99 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  39.76 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12730  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  40.34 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.9 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>