More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02145 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02145  2-nitropropane dioxygenase  100 
 
 		 356 aa  684    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  72.65 
 
 		 358 aa  454  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7235  2-nitropropane dioxygenase NPD  62.39 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6485  2-nitropropane dioxygenase NPD  61.16 
 
 		 359 aa  271  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.820853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  33.9 
 
 		 365 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  34.2 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  33.62 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  33.52 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  33.52 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.64 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.82 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.82 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.63 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.43 
 
 		 354 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.91 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.72 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.57 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.02 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  33.91 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.47 
 
 		 361 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  33.52 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.43 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.38 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.94 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4328  putative 2-nitropropane dioxygenase  37.98 
 
 		 368 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.44 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.87 
 
 		 359 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.53 
 
 		 357 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3913  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.65 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.08 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0259  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.32 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.22 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.53 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0052  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.36 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2830  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.73 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0277  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.73 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  36.84 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3832  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.27 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0185  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.26 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00270922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.36 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.6 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.67 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.54 
 
 		 367 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.93 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.31 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2836  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  43.87 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1707  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  43.87 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.55 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.18 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.07 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0756  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.71 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.52 
 
 		 354 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  36.16 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.51 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.71 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  36.36 
 
 		 359 aa  169  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.23 
 
 		 354 aa  169  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.01 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.51 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3159  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  42.9 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.1 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.73 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.09 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.1 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.08 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.34 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  33.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 		 349 aa  162  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.38 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.81 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.08 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.47 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  36.52 
 
 		 362 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.53 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.31 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.43 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.27 
 
 		 366 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  36.68 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  36.49 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.13 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.39 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  35.45 
 
 		 361 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.31 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.65 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  35.45 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.49 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.12 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.79 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.12 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.4 
 
 		 348 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.78 
 
 		 354 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.83 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>