More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2433 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  100 
 
 		 358 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  80.73 
 
 		 358 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  75.14 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  76.97 
 
 		 356 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  78.77 
 
 		 371 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  77.87 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  60.11 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.91 
 
 		 359 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  62.61 
 
 		 362 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.87 
 
 		 358 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  61.47 
 
 		 354 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.5 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.92 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.12 
 
 		 361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.94 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.06 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  60.06 
 
 		 356 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.48 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.79 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  58.54 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  57.98 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  57.26 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  59.04 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  65.26 
 
 		 350 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5205  2-nitropropane dioxygenase NPD  64.95 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  55.79 
 
 		 344 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.43 
 
 		 353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  58.31 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  51.18 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  54.55 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.14 
 
 		 353 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.97 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.86 
 
 		 353 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.76 
 
 		 346 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.97 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.68 
 
 		 382 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.38 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.27 
 
 		 349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  49.27 
 
 		 349 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.97 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  56.1 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.97 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.1 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  56.1 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.32 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.1 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3007  2-nitropropane dioxygenase NPD  57.6 
 
 		 353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.82 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  53.37 
 
 		 352 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  45.83 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.93 
 
 		 361 aa  298  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  45.98 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.76 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  45.07 
 
 		 350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.4 
 
 		 365 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.45 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.3 
 
 		 367 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  41.81 
 
 		 351 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  42.11 
 
 		 351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.85 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.12 
 
 		 357 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.76 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.44 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.75 
 
 		 355 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.75 
 
 		 355 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.08 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.45 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.32 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0188  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.59 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  42.82 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.54 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  32.93 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.73 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  32.63 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  34.5 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.76 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.14 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.02 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.43 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.93 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  38 
 
 		 363 aa  186  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  31.95 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.17 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  32.43 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.17 
 
 		 366 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  31.83 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  31.83 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1135  hypothetical protein  34.31 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.88 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.28 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.39 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3380  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.71 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  38.44 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.41 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.49 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0191  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.67 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1151  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.13 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.29 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3785  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.47 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109724  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0204  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.3 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>