More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56894 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56894  2-nitropropane dioxygenases  100 
 
 		 385 aa  795    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.45 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.78 
 
 		 354 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.12 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.08 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.6 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3814  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.75 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4010  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.51 
 
 		 349 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1878  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.84 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.842086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  31.97 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3888  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.23 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1908  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.75 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.430969  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2656  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.69 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  32.46 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0445  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.68 
 
 		 349 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  31.94 
 
 		 351 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.04 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.27 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0562  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.81 
 
 		 378 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000315665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.87 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3310  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.54 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.67 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  28.72 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3136  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.04 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278577  normal  0.604759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1176  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.37 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2259  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.34 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.75 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.61 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.31 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.59 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.46 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.16 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.65 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4565  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.72 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.190968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.06 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.84 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3247  dioxygenase  34.6 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0319665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000711  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (FMN)  32.69 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00491947  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.72 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.17 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.38 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.93 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3522  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.61 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0118514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.54 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  34.94 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  30.18 
 
 		 358 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.58 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6840  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.67 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437449  normal  0.0843125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  34.62 
 
 		 364 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3827  hypothetical protein  31.58 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.321595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.05 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.46 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.95 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  34.29 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.95 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  34.62 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1943  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.95 
 
 		 361 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  34.29 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  34.29 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  33.97 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1318  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.62 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.97 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.9 
 
 		 366 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.33 
 
 		 363 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2734  putative oxidoreductase protein  32.51 
 
 		 348 aa  136  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  26.44 
 
 		 362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2433  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.29 
 
 		 358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.769638  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2278  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.35 
 
 		 356 aa  134  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0823525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  33.33 
 
 		 363 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0817  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.5 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3007  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.21 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8522  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.36 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3019  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.49 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4738  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.98 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.217628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0781  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.82 
 
 		 382 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.267134  normal  0.0688656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3501  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.29 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4343  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.99 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147109  hitchhiker  0.000436527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3785  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.3 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109724  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5278  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.97 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5374  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.72 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.64 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3454  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.72 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4912  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.72 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.688478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.13 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0014  2-nitropropane dioxygenase protein  30.29 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.859986  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1418  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.78 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.382357  normal  0.0781529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.27 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3992  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.79 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0024  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.09 
 
 		 351 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00178014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2684  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.84 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5205  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.76 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0271  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.28 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.02 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.5 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1140  hypothetical protein  30.18 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0207  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.66 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12794  hypothetical protein  28.15 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>