52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3952 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  100 
 
 		 550 aa  1078    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  63.62 
 
 		 553 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.47 
 
 		 545 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  50.78 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  52.46 
 
 		 542 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  52.69 
 
 		 542 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  51.08 
 
 		 547 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  51.18 
 
 		 541 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  51.18 
 
 		 548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  50.79 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  50.98 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  50.98 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.49 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.49 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.49 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  50.79 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  49.9 
 
 		 542 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  49.71 
 
 		 532 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.37 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  49.8 
 
 		 525 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  53.95 
 
 		 537 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  46.35 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  49.5 
 
 		 531 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  47.12 
 
 		 556 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  47.72 
 
 		 542 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  52.23 
 
 		 526 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  47.35 
 
 		 557 aa  450  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  50 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  46.3 
 
 		 554 aa  422  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.72 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  45.9 
 
 		 554 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  47.44 
 
 		 530 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.5 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  43.19 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  50.32 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  44.49 
 
 		 481 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  48.62 
 
 		 865 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.56 
 
 		 764 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  45.39 
 
 		 1154 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  38.19 
 
 		 790 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.03 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.41 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.03 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  21.51 
 
 		 1055 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.88 
 
 		 323 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3114  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.95 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3841  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.95 
 
 		 506 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.04 
 
 		 376 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  25.93 
 
 		 378 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.11 
 
 		 378 aa  45.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4714  putative 2-nitropropane dioxygenase  28.84 
 
 		 358 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  27.84 
 
 		 372 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>